โรงเรียนวัดเขียนเขต ได้รับการจัดตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 1 สิงหาคม พ.ศ. 2464 ในชื่อ “โรงเรียนประชาบาลตำบลบึงยี่โถ (วัดเขียนเขต)”
โดยความร่วมมือของ รองอำมาตย์ตรีแต้ม ทับทิมทอง นายอำเภอรังสิต ร่วมกับเจ้าอาวาสวัดเขียนเขต กำนัน ผู้ใหญ่บ้าน และประชาชน
ในท้องถิ่น ใช้อาคารภายในวัดเป็นสถานที่เรียน มี นายถนอม เหลี่ยมสาม เป็นครูใหญ่คนแรก เปิดสอนตั้งแต่ชั้นเตรียมประถมถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 3 มีนักเรียนเริ่มแรกจำนวน 83 คน

​

     ต่อมาเมื่อวันที่ 1 พฤษภาคม พ.ศ.2495 ได้เปลี่ยนชื่อเป็น “โรงเรียนวัดเขียนเขต” และใช้ชื่อนี้มาจนถึงปัจจุบัน
ปี พ.ศ. 2501 ได้สร้างอาคารเรียนใหม่ทางด้านทิศตะวันตกของวัด เป็นอาคารพิเศษ 2 ชั้น ครึ่งตึกครึ่งไม้ ขนาดกว้าง 12 เมตร ยาว 33 เมตร และรับมอบเมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม พ.ศ.2502 นักเรียนได้ย้ายจากศาลาการเปรียญเข้ามาเรียนในอาคารหลังใหม่เมื่อวันที่ 12 สิงหาคมปีเดียวกัน

• พ.ศ.2505 ได้รับอนุญาตให้เปิดสอนถึงระดับชั้นประถมศึกษาตอนปลาย (ป.7)

• พ.ศ.2518 เปิดสอนชั้นเด็กเล็ก เพื่อเตรียมความพร้อมก่อนเข้าประถมศึกษาปีที่ 1

• พ.ศ.2521 ได้รับงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียน 2 หลัง แบบ 017 เป็นอาคาร 2 ชั้น 12 ห้องเรียน ใต้ถุนโล่ง และย้ายไปสร้างในที่ดินของวัดทางด้านทิศเหนือ ซึ่งเป็นที่ตั้งของโรงเรียนในปัจจุบัน

• พ.ศ.2530 ก่อสร้างอาคารเรียนแบบ สปช.2/28 ขนาด 3 ชั้น 12 ห้องเรียน ตั้งชื่อว่า “อาคารเฉลิมพระเกียรติ 60 พรรษา รัชกาลที่ 9”

• พ.ศ.2535 ได้รับอนุมัติให้เปิดการเรียนการสอนระดับชั้นอนุบาล (หลักสูตร 2 ปี) และระดับมัธยมศึกษาตอนต้น (ม.1–ม.3)

 

     ในปี พ.ศ.2545 พระเทพรัตนสุธี เจ้าอาวาสวัดเขียนเขต ได้สร้างอาคารเรียนมอบให้โรงเรียน จำนวน 2 หลัง ได้แก่

• อาคารเรียนขนาด 4 ชั้น 24 ห้องเรียน ชื่อ “อาคารพระองค์เจ้าสาย–หม่อมเขียน”

• อาคารเรียนขนาด 2 ชั้น 8 ห้องเรียน ชื่อ “อาคารหม่อมหลวงฟ่อน สนิทวงศ์”

 

     ต่อมาใน พ.ศ. 2550 โรงเรียนได้รับอนุมัติจากสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน ให้ขยายชั้นเรียนในระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย (ม.4–ม.6) และเริ่มเปิดสอนตั้งแต่ปีการศึกษา 2551 เป็นต้นมา

 

     ปี พ.ศ.2552 องค์การบริหารส่วนจังหวัดปทุมธานี ได้ก่อสร้างอาคารเพิ่มเติมให้โรงเรียนอีก 2 หลัง ได้แก่

• อาคารเรียนขนาด 4 ชั้น ใต้ถุนโล่ง 18 ห้องเรียน 1 หลัง

• อาคารหอสมุดขนาด 3 ชั้น 1 หลัง

​

​

​

​​