โรงเรียนวัดเขียนเขตจัดการเรียนการสอนตามหลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551 และหลักสูตรที่ปรับปรุงเพิ่มเติม โดยมุ่งพัฒนาผู้เรียนให้มีความรู้ ความสามารถ ทักษะที่จำเป็นในศตวรรษที่ 21 ควบคู่คุณธรรม จริยธรรม และคุณลักษณะอันพึงประสงค์ โรงเรียนได้จัดหลักสูตรและแผนการเรียนที่หลากหลาย เพื่อรองรับความแตกต่างระหว่างบุคคลและส่งเสริมศักยภาพของผู้เรียนในทุกช่วงวัย ดังนี้ หลักสูตรและห้องเรียนพิเศษ ห้องเรียนปกติ MEP (Mini English Program) เสริมทักษะภาษาอังกฤษผ่านการเรียนรู้ในรายวิช